• Einführung des Konzepts einer Leseliste (SuperMemo kann nun benutzt werden, um elektronische Texte aus dem Internet zu importieren. SuperMemo 99 hilft dem Benutzer, dem Stoff Prioritäten zuzuordnen, ihn in in handhabbare Portionen zu zerlegen, ihn in Auswahlen, Items oder separate Leselisten umwandeln).
• Einführung des Konzeptes einer Taskliste (Obwohl die Taskliste als Grundlage für die Benutzung von Leselisten in SuperMemo eingeführt wurde,  kann sie auch unabhängig davon als Aufgabenplaner verwendet werden).
• Tasklisten-Manager zur Bearbeitung von Leselisten und Aufgabenlisten.
• Leselisten-Manager-Befehle für Text- und Rich Text-Komponenten (queue extract, remember extract, task extract, queue cloze, remember cloze, usw.)
• Lernen in einem ausgewählten Ast des Wissensbaums, das auch zwischen den Wiederholungssitzungen fortgesetzt werden kann.
• Kategorien-Register für eine bessere Verwaltung einer großen Zahl von Kategorien
• Schablonen können im Schablonen-Register editiert werden.
• Erweiterte und unabhängige Befehle im Inhaltsfenster und im Browserfenster.
• Erweiterte Statistik (z.B. Wiederholungszeit in Tagen, mittlere Wiederholungszeit, tägliche Arbeitszeit in Minuten, und vieles andere)
• Verschiebung des Datumwechsels für diejenigen, die die Wiederholungen erst nach Mitternacht durchführen.
• Neue Benutzeroberfläche mit vier Schwierigkeitsstufen: Anfänger, Basic, Mittel und Professional Level
• Layout-Management
• Manuelle Anpassung der Länge der Wiederholungsintervalle.
• Verbesserte Ordnerverwaltung (Es gibt keine Dialogbox "Children Limit Overflow" mehr).
• Manuelle Korrekturmöglichkeit für die Wiederholungsintervalle.
• Verknüpfen mit einer Schablone kann jetzt auch für kompatible Datentypen (z.B. HTML, RTF oder Text) verwendet werden.
• Wiederholungs-Obergrenze um die Aufnahme neuen Stoffes in den Lernprozeß zu begrenzen.
• Neuverteilung der Wiederholungsintervalle bezogen auf einen einzelnen Ast (und damit auf ein einzelnes Stoffgebiet) des Wissensbaums.
• RTF Garbage collection
• Mit Delphi 4.0 recompiliert.

Siehe auch: Minimale Systemvoraussetzungen